da arte abstracta
Fundo
Há evidências de uma contribuição genética à periodontite crônica. Neste estudo, foi realizado um estudo genoma ampla associação entre os 866 participantes da Universidade de Registro Dental Pittsburgh and Repository DNA, cujo diagnóstico periodontal variou de saúde (N = 767) para periodontite crônica grave (N = 99).
Métodos
Genotipagem
i de mais de meio milhão de polimorfismos de nucleotídeo único foi determinada. As análises foram feitas duas vezes, primeiro no conjunto de dados completo de todas as etnias e, segundo incluindo apenas as amostras definidas como Whites auto-relatados. A partir dos 100 melhores resultados, vinte polimorfismos de nucleotídeo único teve resultados consistentes em ambas as análises (p-valores-limite que variam de 1E-05 a 1E-6) e foram selecionados para serem testados em dois conjuntos de dados independentes derivadas de 1.460 indivíduos de Porto Alegre, e 359 do Rio de Janeiro, Brasil. Foram realizadas meta-análises de polimorfismos de nucleotídeo único mostrando uma tendência para a associação no conjunto de dados independente.
Resultados
O marcador rs1477403 localizado no 16q22.3 mostrou associação sugestiva na fase de descoberta e no conjunto de dados Porto Alegre (p = 0,05). A meta-análise sugeriu o alelo menos comum diminui o risco de periodontite crônica.
Conclusões
Nossos dados oferecem uma hipótese clara a ser testada de forma independente em relação à contribuição do locus 16q22.3 com periodontite crônica.
Palavras-chave
periodontite periodontite crônica periodontite agressiva genética genética médica polimorfismo genético material suplementar Electrónicas | a versão online deste artigo (doi:. 10 1186 /1472-6831-14-84) contém material suplementar, que está disponível para usuários autorizados.
Fundo
Embora estudos familiares sugerem que fatores ambientais são os principais determinantes da variação na periodontite crônica [1-5], as comparações entre-criados juntos e adultos -apart gêmeos monozigóticos indica que o ambiente familiar precoce não tem influência apreciável na condição periodontal dos adultos [6]. Vários estudos de associação têm sido publicados na última década com o objetivo de identificar os fatores genéticos contribuindo para periodontite crônica [7]; No entanto, os resultados não são necessariamente o mesmo, dependendo da população estudada [8].
Mais recentemente, um estudo de associação em todo genoma [9, 10], incluindo 1.020 e 4.504 participantes auto-definida como brancos seleccionados do Atherosclerosis Risk in Comunidades (ARIC) coorte longitudinal sugeriu alguns novos loci para ser possíveis contribuintes para periodontite crônica embora nenhum deles alcançou significância estatística formal. Além disso, as duas listas de polimorfismos de nucleotídeo único associadas da ARIC estudaram amostras [9, 10] não, obviamente, se sobrepõem. Divaris et ai. [9] também incluiu análises baseadas na colonização bacteriana de oito espécies e os resultados sugeriram loci adicionais que possam contribuir para a susceptibilidade individual de ser colonizado por grupos de bactérias específicas.
Neste estudo, levamos em consideração a presença de mistura étnica investigar a associação entre a variação genética e periodontite crônica. Uma varredura de associação do genoma para periodontite crônica foi realizado, incluindo a análise modificada hábitos e status de diabetes fumar e encenado pela adição incremental amostras de diferentes etnias, para abordar o papel dos genes nesta doença. Nossos resultados oferecem uma hipótese clara a ser testada de forma independente em relação à contribuição para a 16q22.3 e 21q22.11 loci para periodontite crônica.
Métodos
amostra Descoberta
Todos os pacientes eram participantes do Registry and Repository Dental DNA (DRDR), da Universidade de Pittsburgh School of Dental Medicine. A partir de setembro de 2006, todos os indivíduos que procuram tratamento na Universidade de Pittsburgh School of Dental Medicine foram convidados a fazer parte do Registro. Eles dão consentimento informado por escrito que autoriza a extração de informações de seus registros dentários. Além disso, eles proporcionam uma amostra de saliva a partir do qual o DNA pode ser extraído. amostras de saliva não estimuladas foram obtidas de todos os participantes (indivíduos foram convidados a cuspir) e armazenados ii à temperatura ambiente até ser processado. Nenhuma centrifugação foi realizada nas amostras de saliva. O DNA foi extraído de acordo com as instruções do fabricante. A Universidade de Pittsburgh Institutional Review Board aprova este projeto e todos os indivíduos assinaram um documento de consentimento informado por escrito antes da participação.
Em janeiro de 2010, os dados de 886 indivíduos foram extraídos a partir do registo para este projeto. Vinte indivíduos com menos de 17 anos de idade foram excluídos. A idade média dos participantes foi de 41,2 anos, com idade variando de 25 a 89 anos. Cento e vinte e oito eram fumantes e 44 tinham diabetes. Os participantes com 30% ou mais dentes com os locais de perda de inserção clínica de cinco milímetros ou mais foram definidos como tendo periodontite crônica [11, 12]. Os participantes que tiveram perda de inserção de cinco milímetros em menos de 30% dos sítios não foram incluídos no estudo. Há casos que foram diagnosticados como periodontite agressiva foram incluídos neste estudo. Noventa e nove pacientes foram diagnosticados com periodontite crônica (42 mulheres e 57 homens com idades variando de 30 a 83 anos). Com base em sua etnia auto-reportados 63 eram brancos, 32 preto e quatro pertencia a outras etnias e estes pacientes compuseram o grupo afetado. indivíduos não afetados foram 767 (382 mulheres e 385 homens com idades entre 25 e 84 anos de idade). Com base em sua etnia 543 declare auto-relataram estar Branco, 158 Preto, e 66 pertencentes a outros grupos (Tabela 1). Detalhes adicionais são apresentados como arquivo adicional 1 (Apêndice 1: "definição do fenótipo"). O Registro e DNA Repository Dental é um projecto de base hospitalar e espera-se que os dados clínicos serão registrados por um número de diferentes profissionais. Todos os registros da pesquisa foram revisados para excluir a possibilidade de que casos podem ter agressiva periodontitis.Table 1 Resumo das populações de estudo
Variável
Pittsburgh
Porto Alegre
Rio de Janeiro
N
866
1.460
359
estatuto periodontite
Afetadas
99 (11,4%)
430 (29,4%)
183 (51%)
não Afectado
767 (88,6%)
1.030 (70,6%)
176 (49%)
A média de idade (anos )
41
40
56
Sex
fêmeas
439 ( 50,7%)
784 (53,7%)
257 (71,6%)
machos
427 (49,3%)
676 (46,3%)
105 (28,4%)
étnica
Branco
606 (70%)
1.188 (81,4%)
288 (80,2%)
preto
190 (21,9%)
272 (18,6%)
71 (19,8%)
Outros
70 (8,1%)
0
0
étnica
Branco
63
348
147
Online em indivíduos com
preto
32
82
36
com periodontite
Outros
4
0
0
Smoker
128 (14,8%)
430 (29,4%)
39 (10,9%)
auto-relato de diabetes
44 (5,1%)
40 (2,7%)
31 (8,6%)
amostras de DNA foram genotipados para 620,901 polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) iii. Detalhes dos nossos cálculos de potência são apresentados como arquivo adicional 1 (Apêndice 2: "Os cálculos de energia do Descobrimento Amostra" e arquivo adicionais 1). A matriz SNP particular escolhido inclui SNPs que são representativos para os indivíduos de ambos ascendência Africano e Europeu [13], que foi considerado um aspecto importante do projeto, uma vez que o grupo de estudo foi composta por indivíduos que são brancos auto-relatados ou negros.
Associação entre o estado periodontite carinho e cada polimorfismo de nucleotídeo único em todo o genoma foi testada usando Plink [14] e todas as análises foram ajustadas por idade, sexo, estado diabetes (sim ou não), e tabagismo (fumante ou não-fumante ), as variáveis que estão associadas com níveis de doença periodontal distintas [15-19]. Os dados sobre os ex-fumantes não foi consistente em todos os conjunto de dados de registro e esta variável não foi utilizado na análise. Na análise do conjunto de dados completo, nós também ajustada para os principais componentes de uma avaliação da estrutura da população, conforme descrito no arquivo adicional 1 (Apêndice 3: "Genome Ampla Analysis," Anexo 4: "Ajuste de Origem no genoma ampla análise "arquivo adicionais 1). Em seguida, repetiu essas análises com amostras de indivíduos brancos somente (arquivo adicional 1). Para levar em conta múltiplos testes, um valor-p inferior a 1E-07 (0,05 /473.514) foi considerado estatisticamente significativo.
Acompanhamento amostras
Dos 100 resultados com os menores valores de p, foram selecionados os mais consistentes resultados (os resultados que continuaram a mostrar uma tendência de associação) de ambas as análises (ie
, análises do conjunto de dados completo e com amostras de apenas indivíduos brancos;. arquivo adicional 1), que composta de vinte polimorfismos de nucleotídeo único (Tabela 2). Estes foram então testados em duas coortes de base populacional independentes do Brasil. Detalhes dessas amostras são fornecidos na Tabela 1 e como adicional de arquivo 1 (Apêndice 5: "Os detalhes das amostras follow up"). Definição da doença periodontal foi utilizado o mesmo que o descrito na descoberta sample.Table 2 Resumo dos resultados do genoma ampla varreduras de associação e a análise independente para periodontite
marcador
frequência do alelo menor crónica
Locus
Localização /gene
Genome varredura valor-p ampla todas as amostras (99 afetados, 767 não afetadas)
Genoma ampla varredura brancos p-valor só (63 afetada , 543 afetados)
Independent Porto Alegre p-valor de coorte (430 afetados, 1.030 afetado)
Independent Rio de Janeiro p-valor de coorte (183 afetados, 176 afetados)
rs10858049
0,19
1p13.2
DENND2C
9.54E-05
0.01
0.78
0.3
rs4572866
0.19
4p15.2
Intergenic
5.80E-05
0.0006
0.49
0.42
rs6905786
0.45
6q16.2
Intergenic
1.41E-05
0.0003
0.65
0.72
rs7740539
0.26
6q21
Intergenic
1.39E-05
2.85E-05
0.16
0.65
rs10266202
0.41
7p21.3
Intergenic
3.89E-05
0.0003
0.68
0.4
rs4735081
0.4
8q23.1
Intergenic
1.80E-05
4.71E-05
0.48
0.86
rs6597536
0.15
9q34.13
MED27
3.62E-05
0.0002
0.91
0.9
rs1954179
0.34
10q25.2
RBM20
7.42E-05
0.0008
0.85
0.82
rs10501568
0.1
11p14.1
dlg2
8.81E-06
9.38E-05
0.58
0.66
rs1026477
0.47
11p14.1
MPPED2
5.48E-05
2.79E-06
0.68
0.98
rs982322
0.31
12q14.1
SLC16A7
3.99E-05
0.0008
0.48
0.74
rs1913208
0.42
13q33.1
Intergenic
6.46E-05
0.0004
0.17
0.6
rs1477403
0.46
16q22.3
Intergenic
6.18E-05
0.0001
0.05
0.66
rs1558878
0.45
17q24.2
ARSG
8.53E-05
0.0004
0.63
0.29
rs8066940
0.42
17q25.3
Intergenic
2.79E-05
0.0004
0.37
0.3
rs7254232
0.38
19q13.32
Intergenic
2.57E-06
0.0005
0.14
0.2
rs2833017
0.45
21q22.11
Intergenic
5.20E-05
0.0004
0.32
0.001
rs9305434
0.33
21q22.11
Intergenic
7.91E-05
0.0008
0.41
0.008
rs2048126
0.46
21q22.11
Intergenic
8.43E-05
0.0008
0.43
0.001
rs466092
0.25
21q22.3
MX2
1.28E-05
1,10E-05
0,14
0,76
Nota: P -Valores estão relacionados com as diferenças na distribuição de polimorfismos de nucleotídeo único entre os indivíduos afetados e não afetados.
para os 20 polimorfismos de nucleotídeo único selecionados para este teste independente, genotipagem foi realizada utilizando TaqMan química [20] e análise de ponto final. IV Todos os marcadores genéticos foram em equilíbrio de Hardy-Weinberg (dados não mostrados). Para determinar a associação entre a doença e qualquer alelo ou genótipo frequência, usamos regressão logística ajustado para idade, sexo, etnia, estado diabetes e tabagismo utilizando Plink [14]. Os dados sobre os ex-fumantes não estava disponível nestes conjuntos de dados. A amostra de Porto Alegre foi também ajustado pelo índice de massa corporal, bem desde que foram disponibilizados estes dados e esta variável tem sido associada a doenças periodontais. valores P igual ou inferior a 0,0025 (0,05 /20) foram considerados estatisticamente significativos para o acompanhamento resultados do estudo.
Meta-análise
A fim de obter uma estatística de resumo para associação com os quatro SNPs que mostraram uma tendência para a associação de uma das seguimento amostras estudadas do Brasil, um de efeitos aleatórios modelo de meta-análise foi utilizada para estimar o odds ratio para a presença do alelo associado determinada pela análise de associação do genoma. Antes de agrupar os dados, estimamos estatística Q de Cochran, que indica o grau de heterogeneidade. Não houve evidência de heterogeneidade significativa em geral (Q = 2,7, p = 0,264). Um modelo de efeitos aleatórios foi utilizado porque inclui componentes de variância, tanto dentro como entre os estudos. Além disso, uma vez que geralmente produz um intervalo de confiança mais amplo do que um modelo de efeitos fixos, o modo de efeitos aleatórios é mais conservadora [21]. Utilizou-se o conjunto de dados completo de Pittsburgh. MedCalc versão 13 foi utilizado (MedCalc Software, Ostend, Bélgica).
Resultados
filtros de qualidade associações amplo estudo
Genoma sobre polimorfismos de nucleotídeo único foram aplicados antes da análise incluindo exclusão de polimorfismos de nucleotídeo único de taxa de falta monomorphic e alta ( & gt; 10%). Do total de 620,901 polimorfismos de nucleotídeo único no chip, 477,410 marcadores passaram controle de qualidade. Havia um adicional de 3.896 marcadores que não estavam em Hardy-Weinberg (p ≤ 0,0001) ou freqüências alélicas menores não foram informativos (frequência ≤ 0,05) e também foram excluídos. Um total de 473,514 marcadores de polimorfismo de um único nucleótido foram usadas para análise. Apesar de não polimorfismos de nucleotídeo único preencheram os critérios conservadores para significância do genoma, múltiplos loci sugestivo, representados por um ou mais associados marcadores com valores de p entre 1E-5 e 1E-6, foram observados na amostra de descoberta (Figura 1). Figura 1 Manhattan enredo que resume os resultados do estudo de varredura ampla do genoma. P-valores atingido o limite de significância de 1E-07. Intercalando cores azuis indicam diferentes cromossomos. O cromossomo Y não foi analisada, portanto, não há marcadores (cor azul) aparecer. Os pontos vermelhos indicam os resultados mais significativos.
Acompanhamento estudos
Foram selecionados 20 individuais polimorfismos de nucleotídeo que tiveram resultados consistentes em ambas as análises da amostra total e brancos auto-relatados apenas para testar em duas coortes independentes (Tabela 2) . Inclusão de sexo, etnia, estado diabetes, tabagismo e índice de massa corporal, juntamente com a idade no modelo não se alterou substancialmente os resultados e dados aqui apresentados são baseados no modelo mais simples ajustado apenas pela idade. O marcador rs1477403 localizado no 16q22.3 foi o único que mostrou uma tendência para a associação no grupo de Porto Alegre, Brasil [odds ratio = 1,2 (95% intervalo de confiança 1,0-1,47); p = 0,05 para o alelo de distribuição, Tabela 2]. Três marcadores em 21q22.11 mostrou uma tendência para a associação (p-valores nominais inferiores a 0,05) com periodontite crônica na coorte do Rio de Janeiro (Tabela 2). Estes marcadores estão em forte desequilíbrio de ligação com o outro (D '= 1,0).
Meta-análise
Figuras 2, 3, 4 e 5 mostram os odds ratio para a associação do rs1477403 em 16q22.3 ea três SNPs em 21q22.11 nas amostras de Pittsburgh, e as duas coortes brasileiras. Apenas rs1477403 mostrar uma associação que é consistente em direção para as três populações estudadas. O alelo menos comum é sub-representadas nos indivíduos afetados pela periodontite crônica, sugerindo um efeito protetor. Os resultados inconsistentes ao longo dos estudos para os outros três 21q22.11 marcadores sugerem uma verdadeira associação entre a periodontite crônica e o locus provavelmente não existe. Figura 2 Resumo dos resultados da meta-análise para rs1477403 (16q22.3).
Figura 3 Resumo dos resultados da meta-análise para rs9305434 (21q22.11).
Figura 4 Resumo dos resultados da meta-análise para rs2833017 (21q22.11).
Figura 5 Resumo dos resultados da meta-análise para rs2048126 (21q22.11).
Discussão
Neste estudo, 2.685 amostras de DNA foram analisados provenientes de dois estudos de coorte e um conjunto de dados de caso-controle. Estes modelos de estudo diferentes explicar a variação de frequência da doença periodontal em cada um dos grupos de estudo que variam de 11% a 50%.
O primeiro passo do nosso estudo incluiu uma ampla análise do genoma. periodontite crônica tem uma prevalência de mais de 47% nos Estados Unidos com base em dados NHANES [22], e em geral o tamanho das amostras mais baixos são necessários para estudar uma doença comum do que uma doença rara [23]. No entanto, com o número relativamente modesto de indivíduos afetados e poder estatístico previsto, implementamos duas estratégias para melhorar o poder estatístico. Foram incluídos, pelo menos, quatro controles para cada caso, o que é considerado o padrão de ouro para o número de casos e controles para ser coletadas em um estudo de genética de caso-controle [23]. Aproximando-se do outro era usar casos com pelo menos 30 sítios% da boca afetados pela periodontite crônica, evitando assim a inclusão de casos menos graves. Esta abordagem é pensado para maximizar a variância de variáveis de previsão (cada variante genética ou X), que de acordo com b x ± t nm-1; α√MSE /NV x (1-R < sup> 2), onde MSE é o erro quadrado médio, n é o tamanho da amostra, V x é a variância de X, e (1-R 2) é a proporção da variância X não é partilhada por qualquer outras variáveis no modelo, irá aumentar a potência e precisão [24]. Embora nenhum single nucleotide polymorphism exibiram associação a genoma ampla importância, várias regiões genômicas mostraram evidências sugestivas para a associação. No entanto, apenas quatro marcadores genéticos em dois loci mostraram também uma tendência para a associação em experimentos independentes com diferentes conjuntos de dados populacionais, e apenas um marcador mostrou associação quando as amostras foram retiradas. Estes resultados são interessantes porque um experimento foi realizado em uma coorte de base hospitalar que dados clínicos obtidos a partir de diferentes profissionais e uma maior heterogeneidade, e os seguintes experimentos foram realizados em coortes e dados populacionais foram coletadas com rigor experimental para aumentar a homogeneidade. rs1477403 está localizado em 16q22.3 e numa sequência de um ARN não codificante descaracterizada (LOC100506172). A mudança de nucleotídeos não é conservada no rato, chimpanzé, orangotango, ou macaque de acordo com os dados disponíveis na UCSC Genome navegador e é improvável que tenha um papel funcional direta, mas esta possibilidade não pode ser excluída.
Nossa abordagem para selecionar marcadores para acompanhamento incluiu comparando os 100 principais resultados das duas genoma análises de verificação de largura. Poderíamos ter priorizado marcadores com base em nossos cálculos de potência iniciais. No entanto, uma suposição justa para doenças periodontais é que as contribuições genéticas individuais são pequenos e se usássemos odds ratio pontos de corte inferior a 1,5, que teria provavelmente várias centenas, se não milhares de possíveis marcadores de seguir. design de dois estágios para a manipulação de SNPs classificados com base em valores de p foram mostrados para melhorar os rankings e para diminuir os valores de significância superestimados [25-28] .Nós também realizada uma análise reuniu-se para ajudar a interpretar os resultados das análises dos quatro SNPs nas três grupos populacionais. Se uma população produz uma grande p-valor para um determinado SNP quando duas outras populações produzidos pequenos para que SNP, parece que há várias razões possíveis. Um seria que o SNP está realmente associado à característica nas populações que conferem o sinal, mas não é o SNP associado à característica no terceiro população. Outra possibilidade é que o SNP está associado com a característica em todas as populações, mas a amostra de indivíduos recolhidos a partir de uma das populações por acaso aconteceu para fornecer baixa potência. Uma terceira possibilidade é claro que o SNP não está associado à característica, e as duas populações que apresentaram um sinal eram ambos os falsos positivos. Se não é, na verdade, a Associação na terceira população, mas a amostra passou a exibir baixa potência, em seguida, enquanto a direcção de qualquer efeito observado na amostra seria esperado ser o mesmo, é também não parece improvável que por acaso pode realmente ser o oposto (p-valores baixos significam tamanhos de efeito próximos de zero numa dada amostra, e como tal, o "efeito" poderia estar em qualquer direcção). Nós supomos que o sinal para o SNP 16q22.3 é real, apesar de a análise individual de uma das populações brasileiras não indica associação (Figura 2). Por outro lado, uma vez que os sinais para os SNPs em 21q22.11 não são consistentes (Figuras 2 a 4), os autores sugerem a evidência para a associação com esse locus é um falso positivo. Estas análises exemplificar o desafio de interpretar resultados para estes tipos de estudos.
O estudo ampla associação primeiro genoma na periodontite estudou o tipo agressivo da doença [8]. Este estudo identificou uma associação com um marcador no locus de GLT6D1
e experiências funcionais sugeriram que a reduzida afinidade de ligação para o locus de GATA3 GLT6D1
poderia ser um componente da fisiopatologia da periodontite [8]. Este lugar não é que estamos sugerindo a ser associada com periodontite crônica. A falta de sobreposição entre os nossos resultados e dos outros [9, 10] em genoma ampla varredura de periodontite crônica e o estudo de Schäfer et al. [8] é provavelmente devido ao facto de que estas duas condições têm influências genéticas diferentes. Nós temos mostrado previamente que os agregados periodontite agressiva em famílias e seu modo mais parcimoniosa de herança é um modelo de transmissão semi-geral que permite a transmissão heterozigoto para variar [29]. Isto é muito diferente do que vemos na periodontite crônica em que nenhuma agregação familiar clara podem ser detectados.
Nossos benefícios de estudo de vários pontos fortes, incluindo dados de polimorfismo de nucleotídeo único do genoma e avaliação rigorosa e exaustiva dos fenótipos. Genotipagem e garantia de controle de qualidade /qualidade produziu dados de qualidade excepcional. Além disso, como um dos primeiro genoma escala associação estudos para periodontite crônica relatada até à data, este estudo realizou a meta principal (do desenho do estudo ampla associação genoma baseada não de hipóteses), de gerar interesse em genes e regiões genômicas previamente não estudado em no contexto da saúde bucal. No entanto, este estudo também destaca os desafios de identificação de genes envolvidos na doença complexa comum, ou seja, que os numerosos genes, principalmente de pequenos tamanhos de efeito, são susceptíveis de contribuir para a periodontite, e que a descoberta de variantes individuais podem ser extremamente difícil. Nossas populações do estudo tinham uma mistura de indivíduos de ambos Branco e preto património e isso dificulta ainda mais qualquer análise, uma vez freqüência do alelo pode ser díspar entre diferentes populações. Mesmo que nós cuidadosamente levou em consideração esse fator, não podemos excluir a possibilidade de que as associações sugestivas encontramos são influenciados pela variação na origem étnica das amostras. Embora a pesquisa sobre a genética da periodontite fica para trás muitas outras doenças complexas comuns proeminentes, este estudo fornece uma plataforma de lançamento para o gene candidato futuro e estudos funcionais de doenças periodontais. A disponibilidade pública desses dados através de portais on-line vai facilitar a utilidade deste estudo na concepção de futuros esforços e colaborações inter-estudo para compreender a genética de doenças periodontais.
Conclusões
Nossos dados oferecem uma hipótese clara a ser testada de forma independente sobre a contribuição do locus 16q22.3 com periodontite crônica.
Notas
iPerformed em uma plataforma Illumina 610-Quad.
iiStored em kits Oragene DNA auto-cobrança (DNA Genotek Inc ., Ottawa, oN, Canadá).
iiiUsing a Illumina Human610-Quadv1_B BeadChip (Illumina Inc., San Diego, CA, EUA).
Detecção HT Sequence ivPerformed em um Applied Biosystems 7900 máquina de sistema (Applied Biosystems Inc., Foster City, CA, EUA).
Declarações
Agradecimentos
os autores agradecem a todos os pacientes que entusiasticamente concordaram em fazer parte deste projeto. Os dados para este estudo foi fornecido pelo Registro e DNA Dental Repositório da Faculdade de Medicina Dentária da Universidade de Pittsburgh. O apoio financeiro para este trabalho foi fornecido pelo NIH Grant 5TL1RR024155.
Síntese dos principais resultados
Um marcador em 16q22.3 está associada com periodontite crônica em várias populações diversas e podem ser de importância para determinar o risco para a doença.
eletrônico material suplementar
12903_2014_413_MOESM1_ESM.doc de arquivo adicionais. 1: informações adicionais sobre a definição do fenótipo, cálculos de potência e genoma ampla associação análises (DOC 667 KB) Autores 'original apresentada arquivos para imagens
Abaixo estão os links para original dos autores submeteram arquivos de imagens. 'arquivo original para a figura 1 12903_2014_413_MOESM3_ESM.tif Autores' 12903_2014_413_MOESM2_ESM.tif Autores arquivo original para 'arquivo original para a figura 3 12903_2014_413_MOESM5_ESM.tif Autores' figura 2 12903_2014_413_MOESM4_ESM.tif Autores arquivo original para a figura 4 arquivo original 12903_2014_413_MOESM6_ESM.tif Autores 'para a figura 5 interesses concorrentes
Os autores não têm interesses conflitantes a declarar. contribuições
dos autores
PF, PLC, KD, HK J-HK realizados manipulação de DNA e todos os experimentos de laboratório. PF, XW, PLC, ECK e ARV analisados e interpretados os dados. PLC, JN, ANH, VQ, LLB, CS, JMG e ARV realizadas actividades relacionadas com o recrutamento assunto, definições fenótipo, e coleta de amostras biológicas. PLC, JMG, CS, e ARV projetou os estudos de coorte originais. Todos os autores revisaram criticamente o manuscrito. Todos os autores leram e aprovaram o manuscrito final.
