Abstract
Fundo
Mais de 90% dos adultos com 20 anos ou mais de idade com dentes permanentes têm sofrido com cárie dentária levando a dor, infecção, ou mesmo perda do dente. Embora a prevalência de cárie tem diminuído ao longo da última década, há ainda cerca de 23% dos adultos dentados que têm lesões de cárie não tratada na os EUA. A cárie dentária é uma doença complexa, afetada por ambos susceptibilidade individual e fatores ambientais. Aproximadamente 35-55% de variação fenotípica cárie na dentição permanente é atribuível a genes, apesar de alguns genes específicos de cárie foram identificados. Portanto, realizamos o primeiro estudo de associação do genoma (GWAS) para identificar genes que afetam a suscetibilidade à cárie em adultos.
Métodos
Cinco grupos independentes foram incluídos neste estudo, totalizando mais de 7000 participantes. Para cada participante, a cárie dentária foi avaliada e marcadores genéticos (single nucleotide polymorphisms, SNPs) foram genotipados ou imputado ao longo de todo o genoma. Devido à heterogeneidade entre os cinco grupos em relação à idade, a plataforma de genotipagem, avaliação de qualidade de cárie dental, e desenho do estudo, primeiro realizado associação do genoma (GWA) analisa em cada um dos cinco grupos independentes separadamente. Em seguida, realizaram três meta-análises para combinar os resultados de: (i) os, coortes Apalaches comparativamente mais jovens (n = 1483) com o bem-avaliada fenótipo cáries, (ii) os relativamente mais velhos, coortes não-Apalaches (n = 5960) com inferiores fenótipos de cárie, e (iii) todos os cinco grupos (n = 7443). Top ranking loci genético dentro e através de meta-análises foram escrutinados para funções biologicamente plausíveis sobre cárie.
Resultados
diferentes conjuntos de genes foram nomeados nas três meta-análises, especialmente entre os grupos etários mais jovens e mais velhos. Em geral, nós identificamos vários loci sugestivo (valor P ≤ 10E-05), dentro ou perto de genes com funções biológicas plausíveis para cárie dentária, incluindo RPS6KA2 e PTK2B, envolvidas na sinalização MAPK p38-depenedent e RHOU e FZD1, envolvido no cascata de sinalização Wnt. Ambas estas vias foram implicados na cárie dentária. ADMTS3 e ISL1 estão envolvidos no desenvolvimento dos dentes, e TLR2 está envolvido na resposta imune a patógenos orais.
Conclusões
Como o primeiro GWAS para cárie dentária em adultos, este estudo nomeados vários novos genes de cárie para futuros estudos, o que pode levar a uma melhor compreensão da cariogênese, e, finalmente, para a melhoria das previsões de doenças, prevenção e /ou tratamento.
Palavras-chave
Dental caries Genetics Genome ampla associação permanente dentição material suplementar Genomics Electrónicas
