Abstract
Apesar de numerosos estudos sobre periodontite, o mecanismo subjacente a progressão da periodontite ainda permanece em grande parte desconhecido. Este estudo teve como objetivo ter um perfil de expressão comparação entre a periodontite e controle normal e para identificar mais genes candidatos envolvidos na periodontite e para obter mais insights sobre os mecanismos moleculares da progressão da periodontite.
Métodos
O perfil de GSE16134 expressão do gene, compreendendo 241 amostras de tecido gengival e 69 amostras saudáveis como controle que foram obtidos a partir de 120 pacientes sistemicamente saudáveis com periodontite (65 com crônica e 55 com periodontite agressiva), foi transferido da Omnibus banco de dados Gene Expression (GEO). genes diferencialmente expressos (degs) em amostras de periodontite foram rastreadas utilizando o pacote limma em R em comparação com amostras de controlo. Gene Ontology (GO) e análise de enriquecimento via sobre as degs foram realizadas por meio do teste de Distribuição Hipergeométrica. A proteína-proteína interacção rede (PPI) dos degs foi construído utilizando Cytoscape, seguida por selecção do módulo de rede utilizando PPI MCODE de encaixe. Além disso, fatores de transcrição (TFS) destes degs foram identificados com base na base de dados TRANSFAC e então uma rede de regulação foi construído.
Resultado
Totalmente, foram identificados 762 degs (507 cima e 255 sub-regulada) em amostras de periodontite . Degs foram enriquecidos em diferentes termos GO e caminhos, como processo imune sistema, processos biológicos de ativação celular, interação receptor de citocina-citocina e vias metabólicas. Catepsina S (CTSS
) e plecstrina (PLEK
) foram as proteínas do cubo da rede PPI e foram selecionados 3 módulos significativos. Além disso, 19 TFs foram identificadas incluindo fator de interferon regulamentar 8 (IRF8) e FBJ murino osteosarcoma viral homólogo oncogene B (FOSB).
Conclusão
Este estudo identificou genes (CTSS
, PLEK
, IRF . -8
, PTGS2
e FOSB
) que podem estar envolvidos no desenvolvimento e na progressão da periodontite
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