Abstract
Fundo
terapia periodontal convencional tem por objectivo controlar o biofilme supra e subgengivais. Embora a terapia periodontal foi mostrado para melhorar a saúde periodontal, não prender completamente a doença. Quase todos os indivíduos em conformidade com a manutenção periodontal continuam a experimentar a perda de inserção clínica progressiva e uma fração deles perde dentes. Um transplante microbiana oral,
pode ser uma nova alternativa para o tratamento de periodontite (inspirado por transplante fecal). Em primeiro lugar, deve ser estabelecido que microbiomes de saúde bucal e periodontite são distintos. Nesse caso, a microbiota associada a saúde pode ser introduzido na cavidade oral de pacientes com periodontite. Isso se relaciona com os objetivos de nosso estudo: (i) para avaliar se as comunidades microbianas de toda a cavidade oral de indivíduos com periodontite eram diferentes ou saúde bucal contrasta com microbiotas de cárie e edentulismo pacientes; (Ii) testar in vitro
se segura concentração de hipoclorito de sódio pode ser utilizado para a erradicação inicial da microbiota bucal original seguido por uma neutralização segura do transplante antes de hipoclorito.
Métodos
Dezasseis brancos adultos saudáveis sistemicamente com sinais clínicos de uma das seguintes condições bucais foram inscritos: periodontite, cáries estabelecidos, edentulismo, e saúde bucal. amostras do biofilme dental foram coletadas a partir de sites sub e supra-gengival, e mucosas orais. O ADN foi extraído e os genes de rRNA 16S foram amplificados. Os amplicons a partir do mesmo paciente foram reunidas, sequenciado e quantificado. placa bucal do voluntário foi tratado com soro fisiológico, hipoclorito de sódio 16 mM e NaOCl neutralizado por tampão ascorbato seguido por plaqueamento em agar sangue.
Resultados Terrenos ordenação de abundâncias de genes rRNA reveladas agrupamentos distintos para os microbiomes orais de indivíduos com periodontite, edentulismo ou a saúde oral. O microbioma oral em indivíduos com periodontite apresentaram a maior diversidade abrigar 29 espécies bacterianas na significativamente maior abundância em comparação com indivíduos com as outras condições avaliadas. indivíduos saudáveis tinham significativamente maior abundância em 10 espécies microbianas em comparação com as outras condições. NaOCl mostraram fortes propriedades antimicrobianas; ascorbato não tóxico foi capaz de neutralizar o hipoclorito.
Conclusões
distintas assinaturas microbianas orais foram encontrados em indivíduos com periodontite, edentulismo, ou a saúde oral. Esta descoberta abre um potencial de uma nova terapia, para que toda a comunidade microbiana relacionada à saúde bucal seriam transplantadas para o paciente doente.
Palavras-chave
bacteriotherapy Microbial transplante de cárie edentulismo Periodontite material suplementar eletrônico complexo Red
A versão online deste artigo (doi:. 10 1186 /s12903-015-0109-4) contém material suplementar, que está disponível para usuários autorizados
Fundo
O microbioma oral humana é composta de uma grande variedade. de microrganismos que desempenham papéis importantes na saúde e na doença. As bactérias, por exemplo, manter a saúde oral e sistémica [1], mas também pode causar a doença. Os bacteriófagos forma diversidade microbiana [2]. Protozoários e fungos consumir restos de comida e outros micróbios [3, 4] e archaea utilizam subprodutos de fermentação para produzir metano [5]. No entanto, em termos de espécies microbianas, a nossa compreensão actual da microbiota oral humana é limitada a alguns microorganismos bem estudadas. Com base no que se sabe sobre estes micróbios, os pesquisadores desenvolveram modelos conceituais com o propósito explícito de determinar a etiologia das doenças orais (por exemplo, [6, 7]). Estes modelos sugerem putativos interacções entre os microrganismos, bem como entre os microorganismos e o anfitrião. Embora esses estudos têm avançado significativamente o campo, estudos recentes mostram que a cavidade oral é um habitat complexo e dinâmico que consiste em centenas de espécies que interagem diferentes [8, 9].
O modelo conceitual para a periodontite é que Porphyromonas gingivalis, forsythia Tannerella , Treponema denticola Comprar e Aggregatibacter actinomycetemcomitans Quais são responsáveis pela doença [6, 10, 11]. A evidência a partir de modelos animais indicaram que estas bactérias podem perturbar a homeostase do tecido por meio da manipulação das vias de sinalização do hospedeiro e uma vez que a imunidade inata é comprometida, causar uma mudança na abundância relativa de micróbios, resultando na inflamação e na perda óssea [12, 13]. No entanto, é bem estabelecido que essas bactérias ou seja, P. gingivalis, T. forsythia, T. denticola, A. actinomycetemcomitans
, também são encontrados em cavidades orais saudáveis (por exemplo, [14-19]). Além disso, P. gingivalis
não é encontrado em até metade dos pacientes com periodontite crônica ou agressiva [20]. O paradoxo desses micróbios estarem presentes em ambas as questões de saúde e doença a validade dos fundamentos conceituais da etiologia da periodontite, que o convida para formas alternativas de pensar sobre a periodontite, bem como outras doenças bucais.
Terapias periodontais convencionais visam o controlo biofilmes supra e subgengivais e gerenciamento de fatores prognósticos, tais como falta de controle glicêmico em pacientes com diabetes mellitus e tabagismo ativo [21, 22]. Embora a terapia periodontal tem sido mostrado para melhorar a saúde periodontal e reduzir a taxa de perda adicional clínica anexo [23, 24] e perda de dentes devido a periodontite [25-27], fica aquém de prender completamente a doença. Quase todos os indivíduos em conformidade com cuidados de manutenção periodontal continuam a mostrar sinais de perda de inserção clínica progressiva, e um a dois terços deles, perder um ou mais dentes durante um longo período de tratamento periodontal de manutenção [28, 29]. Nós acreditamos que um novo pensamento é necessário para encontrar formas de sucesso de tratamento de periodontite.
O conhecimento a partir de um campo diferente indica que uma comunidade microbiana adequada é a chave para manter a resistência contra a infecção. Um exemplo clássico é o microbioma intestinal, que protege o hospedeiro contra Clostridium difficile
(CD) infecção. Especificamente, alguns pacientes desenvolvem colonização CD de seu intestino após o tratamento com antibióticos, que erradica a sua microbioma inata. Uma estratégia bem sucedida para combater CD através do transplante de microbiota intestinal de um dador saudável foi primeiro medicamente gravou mais de 50 anos [30]. (As origens do processo de volta para o 4
th século na China [31]). Especificamente, uma suspensão de fezes tomadas a partir de um parceiro íntimo sistemicamente saudável, é introduzido familiar ou amigo para o tracto gastrointestinal do destinatário através de colonoscopia, enema ou de uma sonda nasogástrica. relatórios de revisão sistemática recente por aproximadamente 90% de eficiência de erradicar a infecção CD por um transplante fecal [32]. Além da infecção CD, outras doenças potencialmente dysbiotic foram encontrados para ser responsivo ao transplante microbiana, tal como a doença inflamatória do intestino, obesidade. Para uma revisão sobre a evolução actual no transplante microbiana do intestino ver Kelly et al. [33].
Inspirado pelo sucesso do transplante fecal, aqui vamos apresentar um conceito de um transplante microbiana como uma terapia potencial para periodontite. Nós encaramos a terapia de que consiste em três etapas: (i) sub-colheita e microbiota supra-gengival de um doador saudável, por exemplo, cônjuge ou um parceiro; (II), efectuar a limpeza, alisamento radicular profundo e a aplicação de um agente antimicrobiano de largo espectro para o paciente periodontite; e (iii) neutralização do agente antimicrobiano imediatamente a seguir por um enxaguamento com uma suspensão microbiana recolhido do dador saudável no paciente periodontite.
Os objectivos do presente estudo foram duas vezes. O primeiro objetivo foi avaliar se toda a comunidade microbiana oral de periodontite foi diferente da cárie estabelecidos, edentulismo, e saúde bucal. O segundo objectivo foi testar uma abordagem para a aplicação de um amplo espectro antimicrobiano seguro (NaOCl) para reduzir significativamente a carga da microbiota existente seguido de neutralização deste agente para o transplante microbiana subsequente.
Métodos
Estudo sujeitos
indivíduos adultos foram recrutados no Departamento de Periodontia da Universidade de Washington, Seattle, WA, EUA e na Secção de Periodontia da Universidade de Düsseldorf, Alemanha. Um termo de consentimento informado para participação no estudo foi obtido a partir dos sujeitos. O estudo foi aprovado pela Universidade de Washington Institutional Review Board, ref. número 3570. Os indivíduos foram inscritos se tivessem um dos seguintes condições clínicas: periodontite severa, a cárie, edentulismo, ou a saúde oral. Um caso a periodontite foi definida como tendo pelo menos 2 locais interproximais em diferentes dentes com perda de inserção clínica (CAL) de 6 mm ou mais e pelo menos um site de interproximal com profundidade de sondagem (PD) igual ou superior a 5 milímetros [34] e um mínimo de 20 dentes permanentes, não incluindo 3 molares Rd. Os indivíduos foram excluídos do grupo periodontite se tivessem múltipla lesão de cárie estabelecido ou usava uma prótese parcial removível. Um caso de cárie foi definido como tendo o seguinte número de dentes com lesões de cárie estabelecidos: 6 ou mais dentes em indivíduos de 20 a 34 anos de idade; 4 ou mais dentes em indivíduos de 35 a 49 anos de idade; e 3 ou mais dentes em indivíduos com 50 anos de idade e mais velhos. cárie estabelecido foi definido como uma lesão classe 4 de acordo com a Detecção de Cárie Internacional e Sistema de Avaliação. O número de dentes com cárie lesão de cárie em casos era maior do que um desvio padrão acima da média da medida cárie no respectivo grupo de idade U.S. A. [35]. Os critérios de exclusão para um caso de cárie foram locais interproximais com CAL, de 4 mm ou mais ou PD igual ou superior a 5 mm [34]. Um caso desdentado teve que ser completamente desdentado em ambos os maxilares e os dentes tiveram de ser extraídos mais de um ano antes da inclusão no estudo. Um caso saudável foi definida como tendo 28 dentes, sem contar 3 molares rd, ou 24 ou mais dentes, sem contar 3 molares rd se pré-molares foram extraídos por motivos ortodônticos ou foram congenitamente ausente sem sinais de via oral doença. Os critérios de exclusão para um caso saudável: tabagismo, perda de dentes permanentes, devido à cárie ou periodontite, sites interproximal com CAL de 4 ou maior ou PD de 5 mm ou mais, ou quaisquer lesões de cárie estabelecidos. Exclusioncriteria para todos os grupos incluídos: lesões na mucosa oral, doenças sistêmicas e uso de antibióticos ou anti-sépticos locais nos 3 meses anteriores ao estudo
coleta de Amostra
para todos, mas os pacientes desdentados, de placa supra e subgengival foi coletado. a partir de seis locais com o mais profundo profundidade de sondagem em cada sextante. Um ponto papel estéril por local foi inserido no aspecto mais profundo da bolsa periodontal ou sulco gengival. Biofilme da mucosa oral foi recolhido passando um cotonete estéril sobre as superfícies epiteliais do lábio, esquerda e direita mucosas bucais, palato e dorso da língua [36]. As amostras foram armazenadas a -80 ° C.
Métodos moleculares
ADN microbiano foi isolado a partir de células por disrupção física e química que utiliza os grânulos de zircónia /sílica e extracção com fenol-clorofórmio em um batedor de grânulo FastPrep-24 [37]. Procariotas genes 16S rRNA foram amplificados utilizando iniciadores universais (27 F e 1392R) usando o kit GemTaq de MGQuest (Cat # EP012). O programa de PCR envolvido um passo de pré-amplificação de 10 ciclos com uma temperatura de recozimento de 56 ° C, seguido de 20 ciclos de amplificação com recozimento temperatura de 58 ° C. Em cada ciclo, o tempo de alongamento foi de 1 min 10 s, a 72 ° C. PCR foi finalizado pelo alongamento prolongado por 5 min. Os produtos de PCR foram purificados com o DNA Clean & amp; colunas concentrador (Zymo Investigação, EUA) e quantificado usando o NanoDrop (Agilent, EUA).
Devido a razões técnicas, para alguns assuntos, subgengival e microbiotas mucosas foram agrupados juntos em um frasco, enquanto que para outros assuntos a subgengival e da mucosa microbiota foram armazenados separadamente. Desde o nosso objetivo foi investigar toda a comunidade microbiana, para o supra armazenados separadamente e amostras microbiota subgengival, iguais quantidades de produto de PCR derivados de amostras de esfregaço e de ponto de papel foram reunidas para cada paciente. Para os pacientes desdentados, não houve amostras de ponto de papel. Cada produto de PCR purificado, 500 ng, foi marcado com um Multiplex Identifier (MID) durante a etapa de preparação Roche rápida Library. Quatro sequências MID-tag, representando cada uma das condições, foram combinados em concentrações equimolares e submetidos a protocolos emPCR e sequenciamento de DNA, conforme especificado pela recomendações do fabricante para o instrumento Roche 454 Jr..
A análise dos dados
As sequências obtidas foram separados pelos respectivos Multiplex Identifier (MID) e enviados para o servidor web MG-RAST [38]. O gasoduto MG-RAST avaliou a qualidade das sequências, sequências curtas removidos (multiplicação de desvio-padrão de comprimento de corte de 2,0) e removeu sequências com bp ambíguo (não-ACGT; número máximo permitido de pares de bases ambígua foi criado a 5). O oleoduto anotada as sequências e permitiu a integração dos dados com amostras metagenomic e genómicas anteriores. A base de dados RDP foi usado como fonte de anotação, com identidade de sequência mínima de 97%, e o valor de corte máximo a 10 -5, e comprimento de sequência mínima de 100 bases. análise de diversidade alfa foi realizado em MG-RAST.
transformação ortogonal dos genes rRNA anotados às suas componentes principais (PC) foi realizado utilizando abundâncias normalizadas [39, 40]. A normalização da abundância foi realizada de forma idêntica ao procedimento utilizado por MG-RAST. Especificamente, abundâncias foram aumentadas por um, log2 transformada, e centrado para produzir valores relativos. Os valores relativos foram padronizadas dividindo-os pelo desvio padrão dos valores de log2 [38]. Os dados foram representados graficamente em um terreno ordenação 2 dimensional. Para determinar a contribuição relativa das espécies microbianas para a trama, deixamos X denota a matriz de 16 por 578 (pacientes por espécie) dos valores de abundância normalizados. A matriz X foi utilizado para produzir uma matriz D 16 × 16 das distâncias entre todos os pares de indivíduos. Análise de coordenadas principais (PCoA, ou seja, o escalonamento multidimensional) foi alcançada através da realização de análise de componentes principais (PCA) sobre a matriz de distâncias, D. A distância métrica Euclidiana foi usada para criar esta matriz, mas esta métrica produziu resultados semelhantes aos quando o foi usada alternativa distância Bray-Curtis. Investigar e visualizar as diferenças entre os quatro grupos de pacientes, os dois primeiros componentes principais, PC1 e PC2, da matriz de distância D foram retidos. Para estabelecer quais as espécies eram mais proeminentemente responsável para os agrupamentos, calculou-se a projecção de cada espécie para o (PC1, PC2) avião; as espécies com maiores projeções são exibidas no painel direito da Fig. 3. Isto é, esta figura mostra um biplot das espécies PC1 e PC2 mais altamente correlacionados.
Teste de Mann-Whitney (alfa = 0,05) foi utilizado para investigar diferença significativa na abundância relativa normalizados. Os dados foram normalizados abundância de duas formas diferentes: MG-RAST normalização tal como descrito acima e matérias-abundâncias normalizada para o número total de lê numa amostra. Diferenças de diversidades alfa por condições foram determinadas usando ANOVA. Dois-tailed t-testes, assumindo variância desigual, foram usadas investigar se havia significativamente diferentes nos meios (alfa = 0,05). Estas análises foram realizadas utilizando SAS JMP.
Experimentos hipoclorito de sódio
De acordo com a concentração sugerido anteriormente [41], as experiências de hipoclorito de sódio foram realizadas com uma diluição de 1:50 da água sanitária 6% (Chlorox, The Clorox Company, EUA), a "solução de trabalho hipoclorito". A diluição corresponde ao NaOCl a 16 mM. O agente de neutralização era um tampão de ascorbato de sódio produzida por ajustamento do pH de uma solução de ácido ascórbico 23 mM com NaOH concentrado até pH 5,3
Três amostras de placa dental de um voluntário foi submetido a três desafios: (i.) Ressuspensão em salina, (ii) re-suspensão na solução de hipoclorito de trabalho e (iii) o re-suspensão em solução de trabalho de hipoclorito que foi previamente neutralizado com um volume igual de tampão de ascorbato. Amostras de placa ressuspensos foram plaqueadas em placas de agar sangue.
concentração de cloro activo foi avaliada por colorimetria grosseiramente iodo. Uma solução colorimétrico continha um volume de 0,1% estabilizado solução de amido (Fisher Scientific) misturada com 0,1 volume de iodeto de potássio 1 M. Dois volumes de solução colorimétrico foram misturados com um volume da solução contendo hipoclorito de sódio. cor azul intensa indicado cloro ativo detectável. colorimetria iodo foi calibrado com uma série de diluição da solução de trabalho de hipoclorito com as seguintes diluições de 1: 200, 1: 400, 1: 800, 1: 1600, 0. A dilution1: 800 mostrou ainda uma pitada de azul, enquanto que 1: 1600 foi totalmente incolor.
Resultados Demografia
Um total de 16 indivíduos, 4 indivíduos com cada uma das condições orais avaliados, foram incluídos no estudo. Dez indivíduos foram da Alemanha e 6 do E.U.A .; 9 eram do sexo feminino e 7 do sexo masculino. A idade dos indivíduos inscritos variou de 28 a 92 anos. Indivíduos com periodontite tinham uma média de 34 locais (variação de 15 a 48) com DP de 4 a 6 mm e 5 locais (variação 4-26) com DP de 7 mm ou mais, enquanto nenhum dos indivíduos com cárie e nenhum dos saudável indivíduos tinham sites com DP de 4 mm ou mais. Indivíduos com cárie teve uma média de 14 dentes (intervalo 9-17) com cárie estabelecidas, enquanto a periodontite e indivíduos saudáveis eram em sua maioria livres de cárie (Tabela 1) .table 1 Demografia da população de doentes
Condition
Parameter
Healthy
Periodontitis
Caries
Edentulous
America/Europe
0/4
2/2
2/2
2/2
Male/Female
2/2
2/2
2/2
1/3
Ages
41 (31-52) a
47 (28-58)
39 (29-49)
77 (58-92)
Número de dentes
27 (25-28)
28 (22-30)
28 (22-31)
0
ICDAS ≥ 4
0
0 (0-1)
14 (9-17)
-
PD ≤ 3 milímetros
100
62 (26-79)
100
-
PD 4-6 mm
0
34 (15-48)
0
-
PD ≥ 7 milímetros
0
5 (4-26)
0
-
ICDAS
Detecção de cárie Internacional e Sistema de Avaliação, 4
denota estabelecida decaimento (sombra dentina), PD
profundidade da bolsa
aMedian (min-max)
microbianas assinaturas
A média (± std ) número de 16S rRNA amplicons sequências por microbiota bucal indivíduo foi 13,104 ± 5,533 (arquivo adicionais 1: Tabela S1). A duração e conteúdo de GC das sequências foi semelhante para todos os indivíduos: 514 ± 10 pb e 53 ± 1 pb, respectivamente. Comparação do número de sequências, comprimento da seqüência ou conteúdo GC não revelou diferenças significativas por condição bucal ou sexo, indicando um conjunto de dados equilibrada. A curva de rarefação da maior parte das amostras se aproximou de saturação, indicando suficiente lê para comparações por condição e sexo (Fig. 1). FIG. 1 As curvas de rarefação obtidos utilizando banco de dados RDP com 97% de similaridade, 100 pb alinhamento mínimo e e-valor de 10-5. Ver Tabela 2 para etiquetas
Alpha diversidade da microbiota bucal em indivíduos com periodontite foi significativamente (p & lt; 0,05) maior em comparação ao encontrado em indivíduos com cárie e desdentados. Embora o microbioma oral foi de mais diversificada em indivíduos com periodontite em comparação com indivíduos saudáveis, a diferença perdeu a significância estatística (p = 0,06) (Fig. 2). A composição da microbiota oral em indivíduos com periodontite foi distintamente diferente do que de todas as outras condições orais. Especificamente, a condição periodontite apresentaram maiores abundâncias de Bacteroides (32%), Fusobactérias (7%), Espiroquetas (5%) e Synergisetes (1%) e menos Actinobactérias (14%) (Fig. 3). Actinobactérias foram mais abundantes na microbiota oral de indivíduos saudáveis (28%) e dentados (34%), seguido por Firmicutes, que ocorreu em abundância de 22% e 30%, respectivamente (Fig. 3). Indivíduos com cárie mostrou abundâncias pouco mais reduzidas de Actinobacteria (19% vs. 29%) e ligeiramente maiores abundâncias de Fusobactérias (5% vs 3%) nas comunidades microbianas orais em comparação com indivíduos saudáveis (Fig. 3). FIG. 2 diferenças diversidade de espécies microbianas entre quatro condições orais. São mostrados os dados brutos, média e desvio padrão. (* P = 0,06, ** p & lt; 0,05, *** p & lt; 0,001, t
-test)
fig. 3 por cento abundância de micróbios por "O complexo vermelho"
Um lote de ordenação com base nos genes 16S rRNA filo e condição
revelou que os microbiomes orais em indivíduos com periodontite, edentulismo, ou saúde bucal formados grupos distintos (Fig. 4, painel da esquerda). A trama ordenação explicou 78% da variabilidade observada. Estes resultados, juntamente com os altos valores de diversidade, sugerem que microbiome oral em indivíduos com periodontite, indivíduos desdentados, e indivíduos saudáveis eram muito diferentes uns dos outros. Permutação MANOVA (pseudo teste F, refs. [42, 43]) mostrou diferenças significativas na abundância das espécies microbianas entre as quatro condições orais (p-valor Bonferroni ajustado de 0,0083). O ajustamento de Bonferroni refere-se aos 6 comparações, i.e., todos os pares dos 4 grupos. A fim de determinar se as bactérias "complexo vermelho" (P. gingivalis
, T. denticola Comprar e T. forsythia
) foram determinantes absolutos para a assinatura microbiana da periodontite, as abundâncias destes organismos foram removidos a partir do conjunto de dados original. MANOVA e ordenação enredo não-paramétrico de análise do conjunto de dados sem bactérias "complexo vermelho" não alteram os resultados mostrados na Fig. 4a ou o valor-p. FIG. Esquerda
painel 4: Lote de ordenação PCoA das amostras orais humanos 16 por condição. Estado: vermelho e, periodontite; azul e, a cárie;
preto, desdentado;
verde, saudável. Direito
painel: Projeção dos principais espécies microbianas que contribuem para os Grupos em Projectar os top 23 que contribuem bactérias sobre a trama PCoA (isto é, biplot) mostra a contribuição relativa das bactérias para a ordenação (Fig 4, à direita.). Uma vez que a finalidade do biplot era predominantemente ilustrativos, o número de espécies apresentadas, 23, foi escolhido com base arbitrária na cauda superior do histograma de projecção (tamanhos de arquivo adicionais 1: Figura S1). P. endodontalis, Prevotella intermedia, T. Vincentii,
e um inculto Porphyromonas
sp. foram encontrados para contribuir para a composição microbiana na periodontite, enquanto um complexo de P. melaninogenica, Fusobacterium nucleatum, P. catoniae, Capnocytophaga ochracea
e C. sputigena, C. gingivalis, Haemophilus parainfluenzae e Neisseria elongata
contribuiu para o composição microbiana de assuntos oralmente saudáveis. Os membros do
Streptococcus e Lactobacillus
foram associados com edentulismo.
As espécies que contribuem para as diferenças na diversidade e os agrupamentos na trama ordenação são apresentados na Tabela 2. Vinte e nove das 587 espécies microbianas teve maior abundância em pacientes com periodontite do que aqueles em outras condições avaliadas. Nos indivíduos saudáveis, 10 das 587 espécies microbianas foram encontradas em maior abundância em comparação com os indivíduos não-saudáveis (Tabela 3) .table 2 espécies bacterianas que tinham abundâncias significativamente diferentes (%) entre indivíduos com a não-periodontite (NP ; por exemplo, saudável, cárie, desdentados) e periodontite (P) abundâncias baseado em teste de Mann-Whitney (alfa = 0,05)
Filo /class
Género /espécies
NP
P
Actinobacteria
Atopobium vaginae
0,01
0,35 *
Actinomyces georgiae
0,05
0,35 **
Actinomyces meyeri
0,10
0,49 **
Bacteroidetes
Porphyromonas endodontalis
0,12
2,91 *
uncultured Porphyromonas sp.
0,04
1,26 *
Porphyromonas gingivicanis
0.00
0,04 **
Tannerella forsythia
0.20
0,83 *
Prevotella intermedia
0,12
3,23 *
Prevotella pallens
0,14
0,85 *
Prevotella pleuritidis
0.00
0,01 **
Prevotella salivae
0.20
0,74 **
Firmicutes /Clostridia
Parvimonas micra
0,12
1,19 *
Eubacterium saburreum
0,07
0,28 *
Pseudobutyrivibrio xylanivorans
0.00
0,06 *
Peptostreptococcus anaerobius
0,07
0,50 *
Firmicutes /Negativicutes
Megasphaera micronuciformis
0,12
0,92 *
Fusobactérias
Leptotrichia Wadei
0,10
0,32 **
Proteobacteria /Deltaproteobacteria
uncultured Desulfobulbus sp.
0.00
0,02 *
Proteobacteria /Epsilonproteobacteria
Campylobacter rectus
0,03
0,14 *
Campylobacter concisus
0,03
0,07 **
espiroquetas /Spirochaetales
Treponema denticola
0,07
1,60 *
Treponema maltophilum
0,01
0,25 *
Treponema meio
0,03
0,29 *
Treponema socranskii
0,05
0,21 *
Treponema sp.
0,03
0,10 *
Treponema Vincentii
0,07
0,71 *
Treponema pectinovorum
0.00
0,04 **
synergistetes
synergistetes bactéria SGP1
0,05
0,23 *
Aminobacterium colombiense
0,01
0,05 *
* diferença significativa usando ambos os métodos de normalização (ou seja, abundância das espécies matérias foram lOG2 transformado, normalizada para produzir valores relativos ((matéria-valores da média) /DTS) versus abundâncias normalizados ao número total de leituras em uma amostra)
** diferença significativa para abundâncias usando dados normalizados apenas para o número total de leituras em uma espécie de amostra
Tabela 3 microbianas que tinha abundâncias significativamente diferentes (%) entre indivíduos com a não saudável (NH; periodontite, cáries, desdentados) e saudável (H) abundâncias baseado em teste de Mann-Whitney (alfa = 0,05)
Filo /class
Género /espécies
NH
H
Actinobacteria
Micrococcus lylae
0.00
0,03 **
Bacteroidetes
Prevotella marshii
0,01
0,09 **
Firmicutes /bacilos
Abiotrophia para-adiacens
0,22
0,60 **
Granulicatella elegans
0.20
0,66 *
Granulicatella adiacens
0,60
1,27 **
Streptococcus iniae
0,04
0,15 *
Firmicutes /Negativicutes
Selenomonas ruminantium
0.00
FIG. Todos os autores leram e aprovaram o manuscrito final.
